La terminal del aeropuerto es pequeña y está bien organizada, pero bastante anticuada y bastante abarrotada en los momentos en que más aviones se reúnen aquí.
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Debido a su reducido tamaño, la orientación del aeropuerto es muy sencilla y las distancias a pie desde la entrada hasta los aviones no superan los 100 metros.
El control de inmigración a la llegada suele ser eficiente y las colas suelen ser de 10-20 minutos.
Trasbordo entre vuelos
Agadir no suele ser un aeropuerto de transbordo y si desea cambiar de un vuelo internacional a otro nacional o entre vuelos internacionales, siempre tendrá que salir de la zona de tránsito y volver a facturar.
Un transbordo nacional (por ejemplo Casblanca - Agadir - Dakhla) es posible sin salir de la zona de tránsito.